Você pode fazer o seguinte procedimento:
1) Scene > Add to Render Queue;

2) Clique na aba "Render";

3) Expanda a cena selecionada;

4) Clique no menu "Settings" nas opções "Output Settings";

5) Escolha "image2 sequence" no combobox "Format";

6) Marque o checkbox "Show all formats and codecs";

7) Escolha "PNG (Portable Network Graphics) image)" e clique no botão "OK";

8) Clique no botão "Render" para renderizar a animação.
