Olá Diego.
Não há necessidade de usar um antivírus apenas para usar seu sistema GNU.
Instalar um antivírus num GNU/Linux pode ser útil caso pessoas que usam windows enviem arquivos para o seu sistema, ou seu sistema seja um servidor de e-mail, pois uma delas poderia enviar um arquivo infectado e outra pessoa copiar e propagar para essa pessoa.
Para isso o mais usado e livre é o clamav.