Você pode fazer isso usando o mogrify
Primeiro instale o imagemagick:
$ sudo apt install imagemagick
Depois rode o comando:
$ mogrify -resize 100x100 imagem.jpg
Modifique o 100x100 para o tamanho que você quer
OBS: Ele vai substituir o arquivo original. Então faça um backup da imagem antes!
Caso você queira manter a imagem original, você pode usar o comando convert. Ex:
$ convert -resize 100x100 imagem.jpg output.jpg
Isso vai criar uma nova imagem chamada output.jpg com o tamanho 100x100